日本大学申请时，学生通常需要准备以下证明：
毕业证明：
由最终毕业学校出具，证明学生完成了规定的学习课程并取得了合格成绩。
成绩证明：
详细列出学生在高中或大学的各科目成绩。
日语能力证明：
非强制，但部分专业或课程可能需要日本语能力测试（JLPT）N2或N1证书，或等同的日语能力证明，如J-test、NAT等。
英语能力证明：
部分专业或课程可能需要托福、雅思或托业等英语语言能力测试成绩。
推荐信：
由教授或工作上的上级出具，推荐学生申请。
健康诊断书：
由市级医院提供的体检证明。
身份保证书：
由保证人出具，证明学生在日本居住期间的合法身份。
其他相关证书：
如奖学金证书、技能等级证书等，作为辅助材料。
请注意，不同大学和课程可能有不同的具体要求，建议提前查阅目标大学的招生简章或咨询留学服务机构以获取最准确的信息。