新疆地区提供硕士研究生教育的大学包括：
新疆大学
特色：双一流/211工程
隶属：新疆维吾尔自治区
石河子大学
特色：国家一流建设学科（化学工程与技术）
隶属：新疆生产建设兵团
新疆医科大学
特色：医学为主，多学科相辅相成
隶属：无特定信息
新疆财经大学
特色：全日制财经类重点高等院校
隶属：无特定信息
塔里木大学
特色：无特定信息
隶属：新疆生产建设兵团
新疆师范大学
特色：无特定信息
隶属：无特定信息
新疆农业大学
特色：无特定信息
隶属：新疆维吾尔自治区
喀什师范学院
特色：无特定信息
隶属：无特定信息
昌吉学院
特色：无特定信息
隶属：无特定信息
新疆艺术学院
特色：无特定信息
隶属：无特定信息
中科院新疆理化技术研究所
特色：无特定信息
隶属：中国科学院
中科院新疆生态与地理研究所
特色：无特定信息
隶属：中国科学院
伊犁师范学院
特色：无特定信息
隶属：无特定信息
中国科学院新疆天文台大学
特色：无特定信息
隶属：中国科学院
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