崇明岛上的高等教育机构包括：
上海外国语大学贤达经济人文学院崇明校区
成立于2004年，是上海市第一批经国家教育部批准的全日制本科独立学院。
以语言和经济类学科为重点，其他学科协调发展。
上海电视大学崇明分校
位于崇明区城桥镇，是崇明区唯一的大学，也是崇明团校的一部分。
华东师大崇明生态研究院
由华东师范大学牵头，协同复旦大学、上海交通大学和崇明区政府共同建设。
崇明大学城
包括上海大学崇明校区、东华大学崇明校区、上海外国语大学崇明校区和上海海洋大学崇明校区。
旨在完善上海高等教育体系，提升学科交叉和科研创新能力。
其他教育机构
包括国家开放大学崇明分校、崇明老年大学、上海健康职业技术学院、上海海粟美术设计学院崇明分院、上海市应用科技学校等。
崇明岛上的大学和专业主要集中在陈家镇地区。随着崇明岛的发展，未来可能会有更多高校进驻，以增强当地的人才培养和科研能力。