截至2024年，集美大学的专业设置涵盖了工学、理学、文学、法学、经济学、管理学等多个学科门类。具体专业如下：
工学
机械设计制造及其自动化
车辆工程
电子信息工程
通信工程
计算机科学与技术
软件工程
土木工程
建筑环境与能源应用工程
给排水科学与工程
环境工程
食品科学与工程
生物工程
理学
数学与应用数学
应用统计学
物理学
化学
应用化学
生物科学
生物技术
文学
英语
日语
德语
法语
西班牙语
葡萄牙语
俄语
翻译
汉语国际教育
法学
法学
知识产权
经济学
经济学
金融学
国际经济与贸易
管理学
工商管理
市场营销
会计学
财务管理
人力资源管理
物流管理
旅游管理
特色专业
机械工程
电子信息工程
土木工程
食品科学与工程
此外，集美大学还设有多个学院，如航海学院、轮机工程学院、水产学院、食品与生物工程学院、体育学院、财经学院、信息工程学院等，每个学院都有其特色专业。例如，航海学院的特色专业包括航海技术、交通运输、物流管理等；轮机工程学院的特色专业包括电气工程及其自动化、轮机工程、船舶电子电气工程等。
建议学生在选择专业时，可以综合考虑自己的兴趣、职业规划以及各专业的就业前景和学科优势，选择最适合自己的发展方向。