海南大学目前设有以下书院：
凤翔书院
成立于2022年3月。
位于海甸校区东坡湖畔。
包含81个班级，学生人数为3216人。
涵盖多个学院和专业。
南海书院
成立于2022年3月29日。
管理9号楼和10号楼的宿舍楼。
现有在校生3111人。
提供个性化、全方位的价值引领、学业引导等。
乘风书院
成立于2022年3月29日。
旨在推进书院制改革和创新人才培养模式。
琼台书院
位于海南省海口市琼山区府城街道中山路琼台师范学院内。
始建于清康熙四十四年（1705年）。
是海南省文物保护单位。
书院制改革旨在推进完全学分制和协同创新中心，为学生提供更加个性化和全面的教育体验。