1999年中国大学排名如下：
1. 清华大学
综合得分：100.00
学术声誉得分：100.00
论文得分：100.00
新生质量得分：65.699
师资得分：100.00
科研经费得分：100.00
2. 北京大学
综合得分：99.612
学术声誉得分：99.612
论文得分：45.67
新生质量得分：96.89
师资得分：64.038
科研经费得分：100.00
3. 南京大学
综合得分：91.86
学术声誉得分：未提供
论文得分：未提供
新生质量得分：未提供
师资得分：未提供
科研经费得分：未提供
4. 复旦大学
综合得分：90.23
学术声誉得分：未提供
论文得分：未提供
新生质量得分：未提供
师资得分：未提供
科研经费得分：未提供
5. 中国科学技术大学
综合得分：89.97
学术声誉得分：未提供
论文得分：未提供
新生质量得分：未提供
师资得分：未提供
科研经费得分：未提供
6. 中国协和医科大学
综合得分：87.60
学术声誉得分：未提供
论文得分：未提供
新生质量得分：未提供
师资得分：未提供
科研经费得分：未提供
7. 浙江大学
综合得分：87.36
学术声誉得分：未提供
论文得分：未提供
新生质量得分：未提供
师资得分：未提供
科研经费得分：未提供
8. 上海交通大学
综合得分：85.18
学术声誉得分：未提供
论文得分：未提供
新生质量得分：未提供
师资得分：未提供
科研经费得分：未提供
9. 南开大学
综合得分：80.00
学术声誉得分：未提供
论文得分：未提供
新生质量得分：未提供
师资得分：未提供
科研经费得分：未提供
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