国内软件工程专业最好的大学有以下几所：
北京航空航天大学：
在教育部第四轮学科评估中，北航软件工程学科获评A+，连续两次入选国家“一流学科”建设名单。北航软件学院作为首批国家示范性软件学院之一，其软件工程学科在国内处于领先地位。
浙江大学：
浙江大学软件工程专业实力强劲，注重培养学生的创新思维和实践能力，在人工智能、大数据处理等领域有独特的教学优势。在第四轮学科评估中，浙大的软件工程获得A+，也是双一流建设学科。
国防科技大学：
作为军事院校，其软件工程专业注重培养学生的系统设计和安全防，在软件工程领域具有很高的声誉。
清华大学：
清华大学在软件工程领域拥有雄厚的师资力量和先进的教学科研设施，注重培养学生的创新能力和实践能力，拥有完善的教学体系和丰富的科研资源。
北京大学：
北京大学以其深厚的学术底蕴和优秀的师资队伍在软件工程领域占据重要地位，教学注重培养学生的综合素质和创新思维。
南京大学：
南京大学软件学院是教育部首批国家级示范性软件学院之一，注重培养学生的实践能力和创新精神，为学生提供了丰富的实践机会和科研项目。
哈尔滨工业大学：
哈工大软件工程学科实力雄厚，竞争相对较小，录取比例较高，注重与国际接轨。
这些大学在软件工程专业的教学和科研方面都有显著的优势，但具体选择哪所大学还需根据个人的需求和偏好来决定。例如，如果你对航空航天软件感兴趣，北航可能是一个更好的选择；如果你希望在人工智能和大数据领域发展，浙江大学可能更适合你。