曼哈顿拥有众多著名的高等教育机构，以下是其中一些知名大学：
哥伦比亚大学（Columbia University）
创立于1754年，位于曼哈顿上西区。
常春藤盟校之一，全球大学排名前列。
纽约大学（New York University）
主校区位于曼哈顿下城，拥有多个校区。
全球声誉高，与多家科技公司相邻。
曼哈顿音乐学院（Manhattan School of Music）
专注于音乐教育，位于曼哈顿。
叶史瓦大学（Yeshiva University）
位于曼哈顿北部，是一所重要的犹太教育机构。
纽约城市大学（City University of New York, CUNY）
历史悠久，是纽约市立大学系统的旗舰学校。
新学院（The New School）
提供多元化的学术课程，位于曼哈顿。
史蒂芬斯理工学院（Stevens Institute of Technology）
以工程、技术和管理等领域为主。
圣约翰大学（St. John's University）
提供多样化的学术和职业课程，位于曼哈顿。
福特汉姆大学（Fordham University）
主校区位于曼哈顿北部。
巴纳德学院（Barnard College）
著名的女子文理学院，位于曼哈顿晨边高地。
这些大学中，哥伦比亚大学和纽约大学尤为突出，不仅在学术上享有盛誉，而且在地理位置上也十分优越，为学生提供了丰富的资源和机会。