2021年软科大学排名中，清华大学、北京大学和浙江大学位列前三，具体排名如下：
清华大学
总分：969.2
类型：综合
省市：北京
北京大学
总分：855.3
类型：综合
省市：北京
浙江大学
总分：768.7
类型：综合
省市：浙江
上海交通大学
总分：723.4
类型：综合
省市：上海
南京大学
总分：654.8
类型：综合
省市：江苏
此外，其他位列全国前十名的大学依次为：
复旦大学
总分：649.7
类型：综合
省市：上海
中国科学技术大学
总分：577
类型：理工
省市：安徽
华中科技大学
总分：574.3
类型：综合
省市：湖北
武汉大学
总分：567.9
类型：综合
省市：湖北
西安交通大学
总分：537.9
类型：综合
省市：陕西
这些排名综合了办学层次、学科水平、师资规模与结构、人才培养、科学研究、高端人才、重大项目与成果等诸多评价指标。清华大学和北京大学一直稳居前两位，浙江大学位列第三，表现十分稳固。