新疆的骨干大学排名如下：
新疆大学
新疆大学简称“新大”，位于新疆维吾尔自治区首府乌鲁木齐，是教育部与新疆维吾尔自治区人民政府“部区合建”的综合性全国重点大学，国家“双一流”建设高校，国家“211工程”建设高校，国家西部大开发重点建设高校。入选了国家“111计划”、中西部高校综合实力提升工程、国家建设高水平大学公派研究生项目、中国政府奖学金来华留学生接收院校、卓越工程师教育培养计划、卓越法律人才教育培养计划、全国深化创新创业教育改革示范高校等。
石河子大学
石河子大学位于新疆维吾尔自治区石河子市，由教育部和新疆生产建设兵团共建，是国家“双一流”建设高校、部省合作共建高校、国家“211工程”重点建设高校、国家“中西部高校综合实力提升工程”和“中西部高校基础能力建设工程”高校。学校先后被评为“全国普通高校毕业生就业工作先进集体”“首批全国毕业生就业典型经验50所高校”“全国普通高等学校毕业生预征工作先进集体”“全国首批深化创新创业教育改革示范高校”等。
新疆医科大学
新疆医科大学是新疆维吾尔自治区重点支持的医学高校，拥有较高的教学水平和研究实力。
新疆师范大学
新疆师范大学是新疆维吾尔自治区重点支持的师范类高校，每年能培养出不少优秀的教师。
新疆农业大学
新疆农业大学是新疆维吾尔自治区重点支持的农业类高校，入选了中西部高校基础能力建设工程、卓越工程师教育培养计划等。
塔里木大学
塔里木大学位于塔里木盆地，是一所综合性大学，具有较强的教学和科研能力。
新疆财经大学
新疆财经大学是新疆维吾尔自治区重点支持的财经类高校，拥有较高的教学水平和研究实力。
伊犁师范大学
伊犁师范大学位于伊犁哈萨克自治州，是一所具有较高教学水平的师范类高校。
喀什大学
喀什大学位于喀什地区，是一所综合性大学，具有较强的教学和科研能力。
新疆工程学院
新疆工程学院是一所工科类高校，专业涵盖了多个领域，尤其是化工环保类、土建类、装备制造类等。
这些排名综合了不同来源的权威信息，建议进一步了解各高校的详细专业设置和学术实力，以便做出更为全面的判断。