清朝时期创办的大学主要包括以下几所：
京师大学堂 （北京大学前身）：成立于1898年，是中国近代第一所国立大学，标志着中国近代国立高等教育的开端。北洋大学
（天津大学前身）：成立于1895年，是中国第一所现代化大学，前身为北洋西学学堂。
南洋公学（上海交通大学前身）：成立于1896年，是中国近代第一所私立大学，以培养实业人才为主。
东南大学：
成立于庚子赔款后，利用赔款资金建立。
山西大学：
成立于1902年，与国立北京大学和国立北洋大学并称为中国最早的三所大学堂之一。
清华大学：
其前身为清华学堂，成立于1911年，是利用美国退还的庚子赔款建立的留美预备学校，1928年更名为国立清华大学，1949年改名为清华大学。
辅仁大学：
成立于1921年，是一所由罗马教廷管理的教会大学。
武汉大学：
是中国建校较早的大学之一，对海内外有较大影响，其前身可追溯到1893年湖广总督张之洞创办的自强学堂。
这些大学在中国高等教育史上具有重要地位，不仅推动了教育模式的现代化，还培养了大量杰出人才，对中国的近代化进程产生了深远影响。