三亚崖州湾大学城目前入驻的大学包括：
1. 海南大学
2. 三亚学院
3. 海南热带海洋学院
4. 海南医学院
5. 三亚航空旅游职业学院
6. 白俄罗斯国立大学中国创新教育研究院
7. 中国地质大学（北京）海南研究院
8. 上海交通大学
9. 中国农业大学
10. 中国海洋大学
11. 北京外国语大学
12. 北京语言大学
13. 中国传媒大学
14. 武汉理工大学
15. 中央民族大学
16. 浙江大学
17. 哈尔滨工程大学
18. 河南大学三亚研究院
这些大学在三亚崖州湾大学城开展研究生培养、科研创新以及产业孵化等活动，为当地及全国的高等教育事业做出贡献