哈佛大学提供众多硕士专业，以下是一些主要的专业设置：
文理学院:
化学系
计算机技术研究中心
应用科学部
生物化学与分子生物学系
地质学系
医学院:
细胞与进化生物学系
免疫学委员会
微生物与分子遗传学系
生物学与生物物理学系
神经生物学系
生物化学系
药物学系
与MIT合建的健康科学部
设计学院:
建筑系
设计专业
教育学院:
管理、教学、计划和社会政策专业
人的发展、课程和学术环境专业
阅读和咨询心理专业
法学院:
法律博士（JD）
法律硕士（LL.M.）
商学院:
工商管理硕士（MBA）
其他专业:
统计学
应用数学
生物工程
环境科学与工程
计算机科学
城市规划
城市设计
公共政策
南非研究
社会人类学
数据科学
计算机科学与工程
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