三明职业大学的前身是 三明高等专科学校，而三明高等专科学校是由三明师范高等专科学校、三明职业大学、三明师范学校在1999年9月合并组建而成的。
具体来说，三明的办学历史可以追溯到1903年12月12日正式开学的全闽师范学堂。1992年，时任全国人大常委会副委员长叶飞为学校前身之一的三明师范学校题词“闽师之源”。1977年秋，三明师范学校大专班成立，1983年12月经省政府批准，正式设立三明师范专科学校。1983年7月，三明职业大学创办，面向全市，为企事业单位和农村培养急需的高等专业人才。
2000年10月15日，三明高等专科学校正式挂牌成立，2004年5月18日，教育部批复福建省人民政府同意三明高等专科学校升格为三明学院。2012年6月，三明学院通过教育部本科教学工作合格评估，2018年1月，学校新增为福建省2018-2020年硕士学位授予培育单位立项建设单位。