樟树市目前拥有以下高等教育机构：
江西农业工程职业学院：
这是一所公办高职院校，其前身是宜春农学院，后宜春农学院本科层次搬迁到宜春办学，专科部分成立了江西农业工程职业学院。
江西樟树中医药职业学院：
这是一所新设立的民办高职院校，根据2023年江西教育厅官网公示，樟树中医药职业学院将落户阁山镇，预计总投资20亿，可容纳8000余人。
江西师范大学健康产业学院：
这所学院将选址在原南昌理工学院樟树校区内，以培养本科生、研究生、硕士和博士为主。
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