南京的著名大学及其出名专业如下：
南京大学 物理学：
南京大学在物理学专业方面历史悠久，科研实力雄厚，培养了众多优秀的物理学家。
化学：化学专业以其先进的教学实验设备和丰富的科研资源著称，为化学领域培养了大批人才。
计算机科学与技术：南京大学的计算机科学与技术专业紧跟国际前沿，研究成果丰硕。
经济学：经济学专业以其严谨的学术研究和紧密的社会联系，培养了大量优秀的经济管理人才。
文学：南京大学的文学专业拥有深厚的学术传统，培养了众多知名作家和学者。
天文学、 地质学、 哲学、 中国语言文学、 软件工程、 金融学、 法学等也是南京大学的重要王牌专业。
东南大学 电子科学与技术：
东南大学在电子科学与技术专业方面具有很高的声誉。
建筑学专业：建筑学专业是东南大学的王牌专业之一。
信息工程：信息工程专业在东南大学的工科中占据重要地位。
城乡规划：城乡规划专业也是东南大学的强项。
电气工程及其自动化：电气工程及其自动化专业在东南大学中享有很高的声誉。
南京航空航天大学 飞行器设计：
南京航空航天大学的飞行器设计专业是其王牌专业之一。
电气工程与自动化：该专业在信息工程、机械工程及其自动化、交通运输等方面表现突出。
生物医学工程：生物医学工程专业在东南大学中具有重要地位。
工商管理：工商管理专业也是南京航空航天大学的强项之一。
南京农业大学 作物学：
南京农业大学的作物学是其王牌专业。
植物保护：植物保护专业在农业科学中具有重要地位。
农业资源利用：农业资源利用专业也是南京农业大学的强项之一。
兽医学：兽医学专业在农业科学中具有重要地位。
食品科学：食品科学专业在农业科学中具有重要地位。
科学技术史、 畜牧学、 公共管理等也是南京农业大学的重要专业。
南京理工大学 武器系统与工程：
南京理工大学的武器系统与工程专业是其王牌专业之一。
化学工程与工艺：该专业在化学工程领域具有很高的声誉。
自动化：自动化专业在工程领域具有重要地位。
机械工程：机械工程专业的实力非常强大。
电子信息工程：电子信息工程专业在电子工程领域具有很高的声誉。
材料科学与工程：材料科学与工程专业在材料科学领域具有重要地位。
计算机科学与技术、 软件工程、 信息管理与信息系统、 武器发射工程等也是南京理工大学的重要王牌专业。
南京信息工程大学 大气科学：
南京信息工程大学的气象相关专业非常强，尤其是大气科学专业在全国高校学科评估中连续多次获得A+等级。
应用气象学：应用气象学专业也是南京信息工程大学的强项之一。
环境科学：环境科学专业在环境保护领域具有重要地位。
计算机科学与技术、 电子信息工程等也是南京信息工程大学的重要专业。
南京医科大学
公共卫生与预防医学：
南京医科大学的公共卫生与预防医学专业在全国高校学科评估中多次位列全国第一。
这些专业在各大学中均具有很高的声誉和学术实力，建议根据个人兴趣和职业规划选择合适的专业进行报考。