南通大学的一些王牌专业包括：
临床医学：
推荐指数4.7，国家特色专业建设点。
土木工程：
推荐指数4.4。
机械工程及自动化：
推荐指数4.5。
电气工程及其自动化：
推荐指数4.6。
汉语言文学：
推荐指数4.5。
医学影像学：
推荐指数4.7。
自动化：
推荐指数4.8。
预防医学：
推荐指数4.6。
国际经济与贸易：
推荐指数4.4。
学前教育：
推荐指数4.7。
口腔医学：
推荐指数4.6。
会计学：
推荐指数4.4。
医学检验技术：
推荐指数4.9。
英语：
推荐指数4.4。
电气类：
推荐指数4.6。
电子信息工程：
推荐指数5.0。
计算机科学与技术：
推荐指数4.8。
数学与应用数学：
推荐指数4.6。
通信工程：
推荐指数4.8。
药学：
推荐指数4.6。
此外，南通大学的纺织工程在全国具有较高声誉，是江苏省“十四五”重点学科。
建议您根据个人兴趣和职业规划，选择最合适的专业。例如，如果您对医学感兴趣，临床医学、医学影像学、预防医学等专业都是不错的选择。如果您对工程类学科感兴趣，机械工程及自动化、电气工程及其自动化、土木工程等专业值得考虑。对于文科生，汉语言文学、英语、会计学专业也是热门选择。