新疆拥有众多高等教育机构，以下是部分知名的大学和学院：
新疆大学
简称：新大
类型：综合性全国重点大学
级别：世界一流大学建设高校（B类）、国家“211工程”重点建设高校、国家西部大开发重点建设高校
特点：入选多个国家级项目，如“111计划”、中西部高校综合实力提升工程等
石河子大学
类型：综合性大学
级别：国家“211工程”重点建设高校、国家西部重点建设高校和省部共建高校
塔里木大学
类型：综合性大学
级别：本科
伊犁师范大学
类型：师范类大学
新疆农业大学
类型：农业类大学
新疆财经大学
类型：财经类大学
新疆医科大学
类型：医学类大学
特点：入选“卓越医生教育培养计划”
新疆工程学院
类型：工程类大学
新疆艺术学院
类型：艺术类大学
昌吉学院
类型：综合类学院
乌鲁木齐职业大学
类型：职业类大学
特点：国家示范性骨干高职院校、自治区示范性高职院校
喀什大学
类型：综合类大学
和田师范专科学校
类型：师范类专科学校
克拉玛依职业技术学院
类型：职业类职业技术学院
新疆的教育机构不仅包括综合性大学，还有师范、农业、医学、工程、艺术等专业特色的院校，以及职业技术学院，满足不同学科的教育需求。