华西医科大学与四川大学的合并原因主要包括以下几点：
提升医学教育和科研水平：
合并旨在通过资源整合和优势互补，提高两校在医学教育和科研方面的整体水平。
资源共享：
华西医科大学作为独立的医科大学，其资源有限，而四川大学作为综合性大学，拥有更广泛的学科门类和优秀的学科交叉能力，合并后可以实现资源共享。
学科交叉和合作：
合并可以促进医学与其他学科的融合，为医学研究和教育带来创新和发展机会。
应对外部压力：
当时华西医科大学面临从卫生部划归四川省管理，并可能失去经费支持和降低招生门槛的压力，合并成为了一种应对策略。
办学规模和质量的提升：
合并后，四川大学办学规模扩大，同时华西医科大学的加入也增强了其医学教育的实力。
历史沿革和现实需要：
华西医科大学有110年的医学教育传统，而四川大学作为综合性大学，需要医学教育与科研临床的协同发展，合并满足了双方的发展需要。
以上是合并的主要原因，但合并也引发了一些争议，如华西医科大学失去独立地位，以及四川大学特色发展受限等问题。这些都是在当时特殊情况下发生的，并随着社会发展和教育改革的深入，可能得到一定程度的纠正