清华大学目前有以下分部：
建筑学院：
包括建筑系、景观学系、建筑技术科学系、城市规划系等。
土木水利学院：
包括水利水电工程系、土木工程系、建设管理系等。
环境学院：
包括环境工程系、环境科学系、环境规划与管理系等。
机械工程学院：
包括机械工程系、精密仪器系、能源与动力工程系等。
航天航空学院：
包括工程力学系、航空宇航工程系等。
信息科学技术学院：
包括电子工程系、计算机科学与技术系、自动化系等。
理学院：
包括数学科学系、物理系、化学系、地球系统科学系、天文系等。
经济管理学院：
包括会计系、经济系、金融系、领导力与组织管理系等。
人文学院：
包括中国语言文学系、外国语言文学系、历史系、科学史系、哲学系等。
社会科学学院：
包括社会学系、政治学系、国际关系学系、心理学系、经济学研究所等。
美术学院：
包括史论分部（艺术史论系）、设计分部（工业设计系、环境艺术设计系等）、美术分部（工艺美术系、绘画系、雕塑系）等。
生命科学学院：
包括生物科学、生物技术等。
材料学院：
包括材料科学与工程等。
临床医学院：
包括临床医学等。
药学院：
包括药学等。
体育部：
包括体育教育等。
电机工程与应用电子技术系：
包括电气工程及其自动化等。
工程物理系：
包括工程物理（能源实验班）等。
化学工程系：
包括化学工程与工业生物工程等。
继续教育学院：
提供成人教育和非全日制教育。
深圳研究生院：
位于深圳，提供研究生教育。
苏世民书院：
提供国际化人才培养项目。
全球创新学院：
进行全球范围内的创新教育和研究。
新雅书院：
提供通识教育和跨学科研究。
核能与新能源技术研究院：
研究核能与新能源技术。
新闻与传播学院：
提供新闻与传播专业的教育。
法学院：
提供法学专业的教育。
五道口金融学院：
提供金融专业的教育。
清华大学还有其它一些研究机构和中心，例如马克思主义学院、临床医学院、药学院等，提供各自领域的教育和研究。清华大学有两个校区，分别是西校区和东校区。
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