截至2024年，马来西亚的博士大学排名如下：
马来亚高等教育学院 （MARA University of Technology）
国际评估中排名第一。
马来西亚理工大学 （Universiti Teknologi Malaysia）
国际评估中排名第二。
马来西亚国立大学 （Universiti Kebangsaan Malaysia）
国际评估中排名第三。
马来西亚国际商学院 （International Business School of Malaysia）
国际评估中排名第四。
马来西亚科学大学 （Universiti Sains Malaysia）
国际评估中排名第五。
此外，根据QS世界大学排名，马来西亚的一些博士申请热门高校排名如下：
马来亚大学 （Universiti Malaya）
2025年QS排名第65位。
博特拉大学 （Universiti Putra Malaysia）
2025年QS排名第148位。
马来西亚理科大学 （Universiti Sains Malaysia）
2025年QS排名第146位。
马来西亚国防大学 （Universiti Pertahanan Nasional Malaysia）
未提供具体排名，但为马来西亚最大的高等军事学府。
马来西亚技术大学 （Universiti Teknologi MARA）
未提供具体排名，但为马来西亚最大的公立高等学府。
这些排名综合了不同来源的评估，建议申请者根据自身的研究兴趣和职业规划，仔细考虑各大学的优势和研究资源，选择最适合自己的博士项目。