繁昌县拥有以下高等教育机构：
安徽机电职业技术学院：
这是一所全日制普通高等职业院校，是国家“双高”计划建设高校，拥有经济与贸易学院电子商务专业和互联网与通信学院计算机应用专业。
安徽农业大学繁昌校区：
位于安徽省芜湖市繁昌县北，是安徽农业大学的重要分部之一，拥有植物科学研究所、繁昌县科技局等科研机构和培训中心。
安徽大学：
虽然主要校区不在繁昌县，但繁昌皖江中学的优秀学子有机会进入安徽大学学习，该校以卓越学术与科技创新著称。
上海理工大学：
虽然主要校区不在繁昌县，但繁昌区与上海理工大学有校地合作关系，上海理工大学在科技成果转化和产业孵化方面与繁昌有合作。
西南大学荣昌校区：
虽然位于重庆市荣昌区，但根据最新研究部署，西南大学将下属部分学院设在荣昌校区，形成“一校两地”办学格局。
繁昌广播电视大学：
位于繁昌县城西郊，是全国示范性基层电大。
繁昌开放大学：
前身为安徽广播电视大学芜湖分校繁昌工作站，后更名为繁昌区开放大学，提供成人高等教育。
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