查理大学提供的专业非常广泛，涵盖了从自然科学到社会科学，从医学到人文科学的各个领域。以下是一些主要的专业领域和具体专业：
自然科学
生物学
环境科学工程
生物医学工程
土木工程
电子计算机工程
物理学
地质学
材料工程
机械工程
数学
化学
医学与健康科学
临床医学
药学
解剖学
护理学
制药学
医学专业
保健专业
物理治疗
产科学
社会科学
人类学
考古学
语言文学文化
音乐
哲学
历史
新闻
国际关系
艺术
经济学
金融
社会学
商学
会计学
金融与商务
人力资源管理
市场营销
管理科学
信息系统
国际管理
MBA
人文与法律
英语教学
幼儿教育
中小学教育
古典文学
艺术史
法律
神学
其他
工业管理工程
信息工程
工程物理
视觉艺术
平面设计
表演艺术
剧场
电视及音效制作
此外，查理大学还提供了一些特色专业和课程，如土著人研究院、能源研究、国际管理、数学、化学、物理等。查理大学的医学院在捷克及国际上都有很高的声誉，拥有多个医学院和广泛的医疗专业。
建议学生在选择专业时，可以根据自己的兴趣和职业规划，综合考虑各个专业的课程设置、师资力量、实习机会以及未来的就业前景。