国务院侨务办公室直属的两所高校是暨南大学和华侨大学。
暨南大学
位置：广东省广州市
历史：前身为1906年创立的暨南学堂，后更名为国立暨南大学，1958年在广州重建。
层次：211工程重点综合性大学，华南地区知名院校。
华侨大学
位置：校本部位于福建省泉州市，厦门和泉州均设有校区。
历史：创办于1960年，1983年被定为“国家重点扶植大学”，1996年由国务院侨务办公室和福建省人民政府共建。
层次：省部共建高校，博士学位授予单位，福建省内知名高校。
这两所大学均坚持“面向海外，面向港澳台”的办学方针，积极开展国际交流与合作