山东省菏泽市共有四所大学，分别是：
菏泽学院：
位于山东省菏泽市，是一所全日制普通本科高校，是数据中国“百校工程”项目建设院校。
菏泽医学专科学校：
位于山东省菏泽市，是一所由山东省人民政府举办的省属公办全日制普通高等专科学校，是国家1+X证书制度试点院校。
菏泽家政职业学院：
位于山东省菏泽市，是一所专科层次的公办全日制普通高等职业院校。
菏泽职业学院：
位于山东省菏泽市，是一所国办全日制普通高等学校。
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