自动化专业考研可以选择的大学有很多，以下是一些推荐院校：
清华大学- 自动化系历史悠久，科研实力强。
哈尔滨工业大学- 电气自动化专业具有悠久历史和优秀师资。
上海交通大学- 自动化专业在智能控制和机器人方向有显著优势。
浙江大学- 自动化专业排名靠前，具有先进的研究和开发能力。
北京航空航天大学- 自动化科学与电气工程学院实力强。
华中科技大学- 自动化专业在就业方向广泛，理论与工科实践结合紧密。
西安交通大学- 自动化学院历史悠久，科研和实验设备先进。
东南大学- 自动化专业实力强劲。
北京理工大学- 自动化专业有优秀的师资力量和科研能力。
南京理工大学- 自动化学院有全日制招生名额增加。
南京航空航天大学- 控制科学与工程等专业有招生计划。
江南大学- 新增“智能科学与技术”专业。
以上信息可以作为参考，但请注意每年的招生情况可能会有所变化，建议关注各学校的官方网站或相关招生信息获取最新数据