南京的大学主要分布在以下几个区域：
仙林大学城 （栖霞区）：南京大学
南京师范大学
南京财经大学
南京邮电大学
南京中医药大学
南京森林警察学院等
江宁大学城
（江宁区）：
东南大学
南京航空航天大学
河海大学
中国药科大学
南京传媒学院
南京医科大学
南京工程学院
南京晓庄学院
金陵科技学院
南京邮电大学等
浦口大学城（浦口区）：
南京信息工程大学
南京工业大学
南京审计大学
南京农业大学
江苏警官学院等
溧水大学城（溧水区）
主要有南京高职园
高淳区
南京财经大学红山学院（高淳校区）
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