根据教育部公布的第四轮学科评估结果以及多个权威排名机构的推荐，国内软件工程专业实力最强的大学包括：
北京航空航天大学：
在多个软件工程专业排名中均位列前十名，尤其在嵌入式系统、航空航天软件等方面具有独特的教学经验。
浙江大学：
在多个软件工程专业排名中均位列前五名，注重培养学生的创新思维和实践能力，在人工智能、大数据处理等领域有独特的教学优势。
国防科技大学：
作为军事院校，其软件工程专业注重培养学生的系统设计和安全防，竞争相对较小，录取比例较高。
清华大学：
在多个软件工程专业排名中均位列第一，拥有雄厚的师资力量和先进的教学设施，注重培养学生的创新能力和实践能力。
北京大学：
通常位列软件工程专业排名前列，依托其强大的计算机科学基础，注重理论与实践相结合。
南京大学：
在多个软件工程专业排名中均位列前五名或前十名，注重理论与实践的结合，拥有多个国家级科研项目和实验室。
上海交通大学：
在多个软件工程专业排名中均位列前十名，拥有高水平的师资队伍和科研平台，注重培养学生的创新思维和工程实践能力。
哈尔滨工业大学：
软件工程学科实力雄厚，竞争相对较小，录取比例较高，注重与国际接轨。
这些大学在软件工程专业的教学、科研和就业方面均表现出色，建议根据个人兴趣、学术目标和地理位置等因素进行选择。