新疆的一些热门大学及其王牌专业包括：
新疆大学
电气工程及其自动化（国家级一流本科专业，国家特色专业）
计算机科学与技术（国家级一流本科专业，卓越工程师培养计划）
化学工程与工艺
中国少数民族语言文学
资源勘查工程
数学与应用数学
土木工程
机械设计制造及其自动化
自动化
电子信息工程
纺织工程
机械工程
计算机科学与技术
俄语
汉语言文学
维吾尔语言文学
哈萨克语言文学
石河子大学
葡萄与葡萄酒工程
农业水利工程
农业机械化及其自动化
中国少数民族语言文学
科学教育
设施农业科学与工程
种子科学与工程
新疆师范大学
汉语言文学
旅游管理
生物科学
思想政治教育
体育教育
小学教育
学前教育
音乐学
地理科学
化学
新疆农业大学
水利水电工程
动物医学
机械设计制造及其自动化
电气工程及其自动化
这些专业根据不同的评价标准和时间点可能会有所变动，请以学校最新公布的信息为准。