对口支援新疆的大学包括但不限于以下几所：
新疆大学
对口支援高校：清华大学、西安交通大学、武汉大学、中南大学、中国人民大学、北京师范大学、大连理工大学、同济大学、北京外国语大学、东华大学、中国矿业大学、中山大学、东北师范大学、厦门大学、四川大学、电子科技大学等。
石河子大学
对口支援高校：北京大学、华中科技大学、华中农业大学、华东理工大学、重庆大学、江南大学、对外经贸大学等。
塔里木大学
对口支援高校：中国农业大学、浙江大学、华中农业大学、东北大学和北京化工大学等。
新疆农业大学
对口支援高校：浙江大学、南京农业大学、西北农林科技大学、北京林业大学、华北电力大学、河海大学、江南大学、合肥工业大学、中国海洋大学等。
其他高校
包括但不限于：北京航空航天大学新疆研究院、北京林业大学乌鲁木齐教学点、北京联合大学乌鲁木齐校区、北京交通大学新疆创新中心、北京科技大学新疆研究院、北京师范大学新疆培训中心、华中科技大学新疆研究院、东北农业大学新疆研究院、南昌大学新疆教学点、南京林业大学新疆教学点、上海理工大学新疆研究院等。
以上信息根据最近更新的数据整理而来，具体支援项目和合作细节可能需要进一步查询相关大学的官方通知或公告