旗山高校主要包括以下几所大学：
福建农林大学旗山校区
地址：福州市闽侯县大学城园区
特色：是福建农林大学在福州地区大学城“两岸教育合作实验园区”建设的核心新校区，拥有材料工程学院、机电工程学院、风景园林与艺术学院、交通与土木工程学院等学院。
福州大学旗山校区
地址：福州市福州大学旗山校区乌龙江北大道西侧
特色：福州大学旗山校区研究生科研楼于2022年7月竣工并正式投入使用，紧邻校园东入口。
福建工程学院（旗山校区北校区）-管理学院
地址：福建省福州市闽侯县大学新区学园路3号
特色：福建工程学院更名为福建理工大学后，旗山校区成为其北校区，并设有管理学院。
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