根据提供的信息，湖南省内考研难度较大的院校包括中南大学、湖南大学和国防科技大学。具体排名如下：
第一梯队
中南大学
湖南大学
国防科技大学
湖南师范大学
湘潭大学
第三梯队
湖南工业大学
湖南工商大学
吉首大学
湖南理工学院
衡阳师范学院
湖南工程学院
邵阳学院
湖南人文科技学院
国防科技大学因其军事背景和强大的学科实力，在湖南省内考研难度中通常被认为是非常高的。这所大学在第四轮教育部学科评估中，多个学科如计算机科学与技术、软件工程、系统科学、管理科学与工程都获得了A级评价，显示了其卓越的实力。