南京拥有多所重点一本大学，以下是部分知名的南京重本大学列表：
南京大学- 教育部直属的全国重点大学，国家“双一流”、“985工程”、“211工程”建设高校。
东南大学- 位于南京，是教育部直属的全国重点大学，国家“双一流”、“985工程”、“211工程”建设高校。
南京航空航天大学- 国家“双一流”、“211工程”建设高校。
南京理工大学- 国家“211工程”建设高校。
河海大学- 国家“211工程”建设高校。
南京师范大学- 国家“211工程”建设高校。
中国药科大学- 国家“211工程”建设高校。
南京医科大学- 国家“211工程”建设高校。
南京邮电大学- 国家“211工程”建设高校。
南京信息工程大学- 知名高等教育机构。
南京农业大学- 知名高等教育机构。
南京工业大学- 知名高等教育机构。
南京林业大学- 知名高等教育机构。
南京中医药大学- 知名高等教育机构。
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