耶鲁大学由多个学院组成，其中包括：
耶鲁学院 （Yale College）
成立时间：1701年
主要提供人文科学、社会科学、自然科学以及工程学本科课程
授予文学士、理学士、文科研究学士学位
耶鲁文理研究生院 （Yale Graduate School of Arts & Sciences）
成立时间：1847年
为耶鲁学院毕业生开设研究生课程
授予文学硕士、理科硕士、哲学硕士、哲学博士学位
专业学院
医学院 （Yale School of Medicine）
授医学博士学位
神学院 （Yale Divinity School）
授神学硕士、宗教文学硕士学位
法学院 （Yale Law School）
授法学研究硕士、法学博士（J.D.）学位以及法学硕士、法律科学博士和刑法博士学位
艺术学院 （Yale School of Art）
授美术硕士学位
戏剧学院 （Yale School of Drama）
授戏剧硕士及博士学位
音乐学院 （Yale School of Music）
授音乐硕士、音乐艺术硕士、音乐艺术博士学位
森林与环境研究学院 （Yale School of Forestry & Environmental Studies）
教授森林学硕士、森林科学硕士、环境研究硕士以及森林学博士学位
建筑学院 （Yale School of Architecture）
授建筑硕士职业学位以及环境设计非职业学位
护理学院 （Yale School of Nursing）
授护理科学硕士学位
机构与管理学院 （Yale School of Management）
授企业管理硕士职业学位，开设机构行为和管理科学方面的博士学位课程
这些学院涵盖了广泛的学科领域，包括非洲研究、美国研究、人类学、应用数学、考古学、建筑、纯美术、美术史、亚洲研究、天文学、生化学、生物科学、化学工程、化学、中文、古典文学、比较文学、电脑科学、东亚研究、生态学、经济、电机工程、工程科学、英文、环境科学、电影研究、农林学、法语、地质学、德语、历史、人文学、国际研究、语言学、数学、机械工程、音乐、宗教研究、哲学、政治科学、心理学、社会学、戏剧、女性研究等