南京市秦淮区拥有多所知名高等教育机构，其中包括：
南京艺术学院：
以艺术为特色，提供丰富的艺术学科教育。
南京中医药大学：
专注于中医药学科，享有高声誉。
南京理工大学：
以工科为主，是“211工程”重点支持的高校之一。
南京航空航天大学：
具有航空、航天、民航特色，多学科协调发展。
解放军理工大学：
新型综合性全军重点院校，培养高素质军事人才。
复旦大学 、 上海交通大学、 浙江大学、 南京大学、 中国科学技术大学：
这些顶尖学府的部分学科在南京也有重要影响。
以上信息基于最近的数据更新，具体的教育资源和学术实力可能会有所变化。建议直接咨询相关院校或访问其官方网站获取最新信息