赫尔辛基大学下辖的学院包括：
1. 神学院（Faculty of Theology）
2. 法学院（Faculty of Law）
3. 医学院（Faculty of Medicine）
4. 文学院（Faculty of Arts）
5. 理学院（Faculty of Science）
6. 教育学院（Faculty of Education）
7. 社会科学学院（Faculty of Social Sciences）
8. 农业与林业学院（Faculty of Agriculture and Forestry）
9. 兽医学院（Faculty of Veterinary Medicine）
这些学院提供从学士到博士的各种专业课程