特洛伊市拥有以下高等教育机构：
美国特洛伊大学 （Troy University, TROY）
成立于1887年，是一所公立大学。
提供学士、硕士和博士学位课程。
拥有七个学院，覆盖人文科学、社会科学、商学等领域。
被普林斯顿评论评为东南部最佳大学之一。
被美国新闻与世界报道列为东南部顶级大学。
提供远程教育，拥有分布在13个国家、美国17个州的66个教育点。
塞奇学院 （Sewanee: The University of the South）
位于特洛伊市附近，是一所历史悠久的私立文理学院。
哈德逊河谷社区大学 （Hudson Valley Community College）
提供各种学位和证书课程。
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