新疆玛纳斯县内的大学包括：
昌吉开放大学（玛纳斯县分校）
性质：国家开放大学办学系统的组成部分，新疆开放大学的县级分校。
使命：面向玛纳斯县开展成人高等继续教育。
特点：作为示范性基层分校，提供新型的高等教育服务。
新疆开放大学（原新疆广播电视大学）
性质：经自治区人民政府批准，受自治区教育厅管理和国家开放大学业务指导。
使命：以促进终身学习为使命，以现代信息技术为支撑，提供学历教育与非学历教育。
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