南京的应用本科大学排名如下：
南京大学
排名：第1名
学校性质：教育部直属的重点综合性大学
东南大学
排名：第2名
学校性质：985、211、双一流高校
南京航空航天大学
排名：第3名
学校性质：985、211、双一流高校
南京理工大学
排名：第4名
学校性质：985、211、双一流高校
河海大学
排名：第5名
学校性质：211、双一流高校
中国药科大学
排名：第6名
学校性质：211、双一流高校
南京师范大学
排名：第7名
学校性质：211、双一流高校
南京工业大学
排名：第8名
学校性质：应用型本科高校
金陵科技学院
排名：第22名
学校性质：应用型本科高校
南京晓庄学院
排名：第23名
学校性质：应用型本科高校
建议：
南京大学和 东南大学在各类排名中均位列前茅，是南京乃至江苏省最为知名的两所综合性大学。
南京航空航天大学、 南京理工大学、 河海大学和 中国药科大学也是南京地区非常优秀的本科高校，具有较高的教学水平和研究实力。
金陵科技学院和 南京晓庄学院等应用型本科高校在就业率和社会认可度方面表现突出，适合注重实践和应用型人才培养的学生。