医药工程大学通常包括多个学院，涵盖药学、中药学、生命科学、医学、工程等多个学科领域。以下是一些具体的学院设置：
药学院：
多数医药工程大学都设有药学院，负责药学相关专业的教学和研究。
中药学院：
专注于中药学及相关领域，如中药资源与开发、中药制药等。
生命科学与技术学院：
涵盖药学（国家生命科学与技术人才培养基地）、生物制药、生物技术等。
国际医药商学院：
涉及工商管理（医药方向）、国际经济与贸易（医药方向）、市场营销（医药方向）等。
基础医学与临床药学学院：
结合基础医学与临床药学，培养具备临床药学知识的人才。
理学院：
包括信息管理与信息系统等，提供理科基础教学。
工学院：
涵盖制药工程、食品质量与安全、环境科学等工程类专业。
马克思主义学院：
负责思想政治教育和马克思主义理论教学。
外国语学院：
提供英语（医药方向）等语言教学。
继续教育学院：
负责成人教育和继续教育工作。
高等职业技术学院：
提供药学、中药学等专科（高职）专业教育。
生物药物学院：
专注于生物药物的研发和教学。
现代制药产业学院：
结合产业需求，培养现代制药方面的人才。
国际教育学院：
负责外国留学生和进修生的教学。
公共卫生学院：
专注于公共卫生领域的教学和研究。
护理学院：
提供护理专业的教学。
健康学院：
关注健康科学和健康管理。
中医学院：
专注于中医及相关专业的教学。
口腔医学院：
涉及口腔医学的教学和研究。
药学院：
可能包括基础药学专业点等特色专业。
这些学院设置可能会因学校类型、历史背景、学科发展等因素有所不同。建议直接咨询相关学校的官方渠道或查阅最新的学校介绍，以获取最准确的学院设置信息。