深圳的合作大学包括以下几所：
华南农业大学：
与深圳市光明区人民政府签署了共建华南农业大学深圳研究院合作框架协议，聚焦“大农业、大健康、大食物”发展方向，开展科技创新和成果转移转化。
电子科技大学：
中标电子科技大学（深圳）高等研究院项目，致力于建设集技术研发、成果转化、企业孵化、人才培养等功能于一体的创新型科技服务与产业支撑平台。
中山大学·深圳：
重点发展低空相关学科，为低空经济发展提供人才支撑。
深圳理工大学：
未详细列出合作内容，但属于研究型高校。
香港中文大学（深圳）：
一所中外合作办学类高校。
深圳北理莫斯科大学：
由深圳市政府、北京理工大学和国立莫斯科罗蒙诺索夫大学三方合作设立的中外合作大学。
广东以色列理工学院：
由以色列理工学院与汕头大学合作办学的中外合作大学。
中国民航大学：
与光明区达成战略合作框架协议，开展实地调研和沟通交流。
天津大学佐治亚理工深圳学院：
由天津大学与佐治亚理工学院合作在深圳设立。
东莞理工学院法国国立工艺学院联合学院：
未详细列出合作内容，但属于联合学院。
南方科技大学：
与大鹏新区签订协议，共建海洋科学研究院和开展基础教育合作办学。
清华大学深圳研究生院：
直属清华大学，是清华大学与深圳市合作创建的高层次人才培养基地。
这些合作大学通过不同的合作模式和项目，为深圳的科技创新、产业发展和人才培养提供了强有力的支持。建议关注各合作大学的官方网站和最新动态，以获取最新的合作进展和详细信息。