武汉工程大学的王牌专业包括：
1. 化学工程与工艺
2. 制药工程
3. 过程装备与控制工程
4. 高分子材料与工程
5. 应用化学
6. 智能科学与技术
7. 环境工程
8. 软件工程
9. 电气工程及其自动化
10. 无机非金属材料工程
11. 电子商务
12. 测控技术与仪器
这些专业被广泛认为在武汉工程大学中是最具竞争力和影响力的，其中化学、材料科学、工程学3个学科已进入ESI全球排名前1%，位列湖北省属高校第一。
请注意，专业排名可能会随着时间和学校政策的变化而有所调整，建议以武汉工程大学最新公布的信息为准