新疆的对口支援大学包括：
1. 对口支援新疆大学的高校有16所，分别是：
清华大学
西安交通大学
武汉大学
中南大学
中国人民大学
北京师范大学
大连理工大学
同济大学
北京外国语大学
东华大学
中国矿业大学
中山大学
东北师范大学
厦门大学
四川大学
电子科技大学
2. 对口支援新疆农业大学的高校有9所，分别是：
浙江大学
南京农业大学
西北农林科技大学
北京林业大学
华北电力大学
河海大学
江南大学
合肥工业大学
中国海洋大学
新疆的本科院校还包括新疆大学、塔里木大学、新疆农业大学、石河子大学、新疆医科大学、新疆师范大学、喀什大学、伊犁师范大学、新疆财经大学、新疆艺术学院、新疆工程学院、昌吉学院等。
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