是的，复试专业课通常会有分数线。具体来说，自主划线的院校会设定自己的复试分数线，这个分数线一般比国家线要高。没有自主划线权的学校则会设置自己的专业课分数线，这个分数线一般比国家线稍高或者持平。国家层面也会公布统一的考研复试基本分数线，即国家线，考生需要达到这个分数线才能进入复试。
此外，不同学校和专业的分数线也可能存在差异，因此考生需要关注自己所报考学校和专业的具体分数线要求。
综上所述，无论是自主划线院校还是非自主划线院校，复试专业课通常都会设定相应的分数线。建议考生在准备复试时，除了关注国家线外，还要特别关注所报考学校和专业的具体分数线要求。