南京的日本学校包括南京木下日语学校。这所学校起源于东京木下日本语学园，是一家专业的日本语教育机构，具有丰富的日语教学经验，并因其在日语教学和日本与世界文化交流方面的贡献，在2008年获得日本文部科学省特别表彰。
另外，南京师范大学附属实验学校设有中日班，该项目已有5届毕业生，学生升学成果显著，100%升入日本大学，其中60%的学生考入了在日本及亚洲享有盛誉的世界名校，如东京工业大学、新泻大学、立命馆大学、关西学院大学等。
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