西安工程大学作为一所以工科为主的普通本科高校，存在一些缺点，主要包括：
名称混淆
西安工程大学的名字与其他工程类大学相似，容易混淆，给人陌生和困惑的感觉。
定位和发展方向模糊
学校改名后，原有的特色和优势似乎丧失，导致一些老牌优势专业不再突出，而新增专业缺乏竞争力。
办学水平和就业质量下滑
学校整体办学水平和就业质量出现下滑，在全国大学排行榜上的排名不高。
专业就业前景不佳
西安工程大学的王牌专业，如纺织工程，就业渠道窄，就业质量不高，且工作环境一般。
地理位置不利
学校位于西安市，但当地纺织企业较少，未能形成产教融合的局面，毕业生需回到东南沿海就业，与层次更高的大学如东华大学竞争。
基础设施问题
学校网速差，联通信号不佳，宿舍设施简陋，公共厕所卫生条件差，且存在停水问题。
学风问题
有观点认为学校学风不佳，但实际上学校中有不少考研成功的例子，且计算机学院等学院有学生考入了知名高校。
专业设置争议
除了王牌专业外，其他专业可能存在不被看好的情况，这可能与专业设置与企业需求之间的匹配程度有关。
以上是根据提供的信息整理的西安工程大学的缺点。