日本的研究型大学众多，以下是一些著名的研究型大学：
东京大学（The University of Tokyo）
简称：东大
类型：综合性国立大学
特色：日本学术殿堂，七所旧帝国大学之首，全球享有极高声誉。
京都大学（Kyoto University）
简称：京大
类型：国立研究型大学
特色：学科齐全、规模宏大，被誉为“科学家的摇篮”。
东京工业大学（Tokyo Institute of Technology）
类型：理工科大学
特色：专攻工程技术与自然科学，世界领先的研究型大学之一。
九州大学（Kyushu University）
类型：国立研究型大学
特色：拥有良好的学风，治学严谨，重视实践和研究。
北海道大学（Hokkaido University）
类型：研究型综合性大学
特色：以研究生院为核心，在札幌市和函馆市设有两个校区。
大阪大学（Osaka University）
类型：地方帝大
特色：文系类研究科竞争激烈，经济学研究科等具有较高的入学难度。
北陆先端科学技术大学院大学
类型：国立研究型大学
特色：专注于高端科学研究，实行多导师制和主课题/副课题制。
早稻田大学（Waseda University）
类型：顶尖研究生教育机构
特色：自由开放的学风，涵盖多个学科领域，致力于培养具有创造力和国际视野的研究型人才。
庆应义塾大学（Keio University）
类型：私立研究型综合大学
特色：以严谨的学术风气和开放的研究方式著称。
东北大学（Tohoku University）
类型：国立研究型大学
特色：在自然科学领域排名世界第35位，多个学科处于世界领先地位。
这些大学在日本乃至全球都享有极高的声誉，提供广泛的研究课程和先进的科研设施，是许多留学生追求学术和研究的目标学校