北京大学的院系设置非常全面，涵盖了多个学科领域。以下是一些主要的院系：
1. 理学部
数学科学学院
物理学院
化学与分子工程学院
生命科学学院
城市与环境学院
地球与空间科学学院
心理与认知科学学院
建筑与景观设计学院
2. 信息与工程科学部
信息科学技术学院
工学院
计算机科学技术研究所
软件与微电子学院
环境科学与工程学院
软件工程国家工程研究中心
3. 社会科学学部
国际关系学院
法学院
信息管理系
社会学系
政府管理学院
马克思主义学院
教育学院
新闻与传播学院
体育教研部
4. 人文学部
中国语言文学系
历史学系
考古文博学院
哲学系（宗教学系）
外国语学院
艺术学院
对外汉语教育学院
歌剧研究院
5. 医学部
基础医学院
药学院
公共卫生学院
护理学院
医学人文学院
医学继续教育学院
第一医院、人民医院、第三医院、口腔医院、北京肿瘤医院、第六医院、深圳医院、首钢医院、国际医院、滨海医院
6. 经济与管理学部
经济学院
光华管理学院
人口研究所
国家发展研究院
7. 跨学科类学部
包含多个跨学科的研究中心和学院
此外，北京大学还在深圳设有研究生院（分校）。
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