当前中国拥有笛子专业的著名大学主要包括：
1. 中央音乐学院 - 国内唯一一所拥有笛子专业的高等音乐学府，享有国际声誉。
2. 上海音乐学院 - 笛子专业优秀，教学内容丰富，涵盖演奏、乐理、音乐等方面。
3. 中国音乐学院 - 笛子专业注重演奏技巧和音乐表现力，同时强调音乐理论和历史知识。
4. 沈阳音乐学院、天津音乐学院、西安音乐学院、武汉音乐学院、四川音乐学院、星海音乐学院 - 这些院校的笛子专业也享有较高的评价。
此外，一些综合类大学也提供笛子专业或音乐表演专业，但专业的音乐学院在师资力量和教学资源上更具优势。