中国扎根祖国边疆的大学包括：
黑河学院：
位于黑龙江省黑河市，是中国最北边的大学，也是中俄边境线上中国境内唯一的本科院校。
塔里木大学：
位于新疆南部塔里木河畔的阿拉尔市，是一所服务于边疆地区的高等教育院校。
喀什大学：
位于新疆西部，是中国最西部的大学之一。
海南热带海洋学院：
位于海南省，是教育部十大“教育援外基地”之一。
黑龙江工业学院：
位于中俄边境城市鸡西，是一所公办综合性全日制大学。
延边大学：
位于吉林省延边朝鲜族自治州首府延吉市，是国家“双一流”建设高校。
石河子大学：
位于新疆生产建设兵团第八师石河子市，是一所重点建设的边疆大学。
这些大学在各自的边疆地区发挥着重要作用，为当地的经济和社会发展做出了贡献。